Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Olfr479-201ENSMUST00000063151 1111 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Uts2b-201ENSMUST00000070531 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm5458-201ENSMUST00000096121 997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Olfr259-201ENSMUST00000099862 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gm36879-201ENSMUST00000212313 2060 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Upp2-203ENSMUST00000102755 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 9930022D16Rik-201ENSMUST00000055404 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Erg-202ENSMUST00000113846 3249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Npr3-204ENSMUST00000228489 1969 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Caps2-203ENSMUST00000170013 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 5330439K02Rik-201ENSMUST00000180953 2312 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Zfp626-202ENSMUST00000205671 5329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Gm21887J3QQ04 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Olfr183-204ENSMUST00000214831 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 9230106D20Rik-201ENSMUST00000052806 1406 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Fbxw14-203ENSMUST00000198844 1786 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Gm14576-201ENSMUST00000118073 1111 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Thbs3-202ENSMUST00000119084 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Gm13121-201ENSMUST00000120637 632 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Fpr2-202ENSMUST00000149944 883 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Platr16-202ENSMUST00000150529 545 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Gm25713-201ENSMUST00000158625 109 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Gm22111-201ENSMUST00000178010 79 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Gm23687-201ENSMUST00000178664 79 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Gm24566-201ENSMUST00000179286 79 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Gm23305-201ENSMUST00000179342 79 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Gm26389-201ENSMUST00000179819 79 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Gm22130-201ENSMUST00000179979 79 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Gm22393-201ENSMUST00000180153 79 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Gm25085-201ENSMUST00000180298 79 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Gm29007-201ENSMUST00000190633 679 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Gm6321-201ENSMUST00000194460 1090 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Gm38360-201ENSMUST00000195130 454 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Gm37021-201ENSMUST00000195835 663 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Gm21887J3QQ04 Gm42793-201ENSMUST00000199139 1252 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms