Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Gm2035J3QP87 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Gm2035J3QP87 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Gm2035J3QP87 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Gm2035J3QP87 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Gm2035J3QP87 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Gm2035J3QP87 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Gm2035J3QP87 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
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Gm2035J3QP87 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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