Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm20795J3QP49 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm20795J3QP49 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms