Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Smim18J3QNP2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Smim18J3QNP2 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Smim18J3QNP2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim18J3QNP2 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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