Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp9yF8VPU6 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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