Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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