Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Length 401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5538W4VSP6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5538W4VSP6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5538W4VSP6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5538W4VSP6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5538W4VSP6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5538W4VSP6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5538W4VSP6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5538W4VSP6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm5538W4VSP6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm5538W4VSP6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm5538W4VSP6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm5538W4VSP6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm5538W4VSP6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5538W4VSP6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5538W4VSP6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5538W4VSP6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5538W4VSP6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5538W4VSP6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5538W4VSP6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5538W4VSP6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5538W4VSP6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm5538W4VSP6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5538W4VSP6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5538W4VSP6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5538W4VSP6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5538W4VSP6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm5538W4VSP6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5538W4VSP6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5538W4VSP6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5538W4VSP6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5538W4VSP6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5538W4VSP6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5538W4VSP6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm5538W4VSP6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5538W4VSP6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5538W4VSP6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5538W4VSP6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5538W4VSP6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5538W4VSP6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5538W4VSP6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm5538W4VSP6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5538W4VSP6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5538W4VSP6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5538W4VSP6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm5538W4VSP6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5538W4VSP6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm5538W4VSP6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm5538W4VSP6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5538W4VSP6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5538W4VSP6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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