Protein–RNA interactions for Protein: S4R1R7

Rpl9-ps1, MCG50795, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl9-ps1S4R1R7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpl9-ps1S4R1R7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpl9-ps1S4R1R7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpl9-ps1S4R1R7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpl9-ps1S4R1R7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpl9-ps1S4R1R7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpl9-ps1S4R1R7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpl9-ps1S4R1R7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpl9-ps1S4R1R7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpl9-ps1S4R1R7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpl9-ps1S4R1R7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rpl9-ps1S4R1R7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rpl9-ps1S4R1R7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpl9-ps1S4R1R7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rpl9-ps1S4R1R7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpl9-ps1S4R1R7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpl9-ps1S4R1R7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpl9-ps1S4R1R7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl9-ps1S4R1R7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl9-ps1S4R1R7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl9-ps1S4R1R7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl9-ps1S4R1R7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl9-ps1S4R1R7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl9-ps1S4R1R7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl9-ps1S4R1R7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpl9-ps1S4R1R7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpl9-ps1S4R1R7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpl9-ps1S4R1R7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpl9-ps1S4R1R7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpl9-ps1S4R1R7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpl9-ps1S4R1R7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpl9-ps1S4R1R7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpl9-ps1S4R1R7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpl9-ps1S4R1R7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpl9-ps1S4R1R7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpl9-ps1S4R1R7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpl9-ps1S4R1R7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpl9-ps1S4R1R7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpl9-ps1S4R1R7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpl9-ps1S4R1R7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl9-ps1S4R1R7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl9-ps1S4R1R7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl9-ps1S4R1R7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl9-ps1S4R1R7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl9-ps1S4R1R7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl9-ps1S4R1R7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl9-ps1S4R1R7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpl9-ps1S4R1R7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpl9-ps1S4R1R7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpl9-ps1S4R1R7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms