Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubl3Q9Z2M6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubl3Q9Z2M6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubl3Q9Z2M6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubl3Q9Z2M6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubl3Q9Z2M6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubl3Q9Z2M6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubl3Q9Z2M6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubl3Q9Z2M6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubl3Q9Z2M6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubl3Q9Z2M6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubl3Q9Z2M6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubl3Q9Z2M6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubl3Q9Z2M6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubl3Q9Z2M6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubl3Q9Z2M6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubl3Q9Z2M6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubl3Q9Z2M6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubl3Q9Z2M6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubl3Q9Z2M6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubl3Q9Z2M6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubl3Q9Z2M6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubl3Q9Z2M6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubl3Q9Z2M6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubl3Q9Z2M6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubl3Q9Z2M6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubl3Q9Z2M6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubl3Q9Z2M6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubl3Q9Z2M6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubl3Q9Z2M6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubl3Q9Z2M6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubl3Q9Z2M6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms