Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ddx39bQ9Z1N5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddx39bQ9Z1N5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddx39bQ9Z1N5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddx39bQ9Z1N5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ddx39bQ9Z1N5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddx39bQ9Z1N5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddx39bQ9Z1N5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddx39bQ9Z1N5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddx39bQ9Z1N5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddx39bQ9Z1N5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddx39bQ9Z1N5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddx39bQ9Z1N5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ddx39bQ9Z1N5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx39bQ9Z1N5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx39bQ9Z1N5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx39bQ9Z1N5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx39bQ9Z1N5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx39bQ9Z1N5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx39bQ9Z1N5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx39bQ9Z1N5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx39bQ9Z1N5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ddx39bQ9Z1N5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx39bQ9Z1N5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx39bQ9Z1N5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx39bQ9Z1N5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx39bQ9Z1N5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx39bQ9Z1N5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx39bQ9Z1N5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx39bQ9Z1N5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx39bQ9Z1N5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx39bQ9Z1N5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ddx39bQ9Z1N5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddx39bQ9Z1N5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddx39bQ9Z1N5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddx39bQ9Z1N5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddx39bQ9Z1N5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddx39bQ9Z1N5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ddx39bQ9Z1N5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddx39bQ9Z1N5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddx39bQ9Z1N5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddx39bQ9Z1N5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ddx39bQ9Z1N5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ddx39bQ9Z1N5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ddx39bQ9Z1N5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ddx39bQ9Z1N5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddx39bQ9Z1N5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddx39bQ9Z1N5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddx39bQ9Z1N5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddx39bQ9Z1N5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ddx39bQ9Z1N5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddx39bQ9Z1N5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddx39bQ9Z1N5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms