Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna2d3Q9Z1L5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna2d3Q9Z1L5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacna2d3Q9Z1L5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms