Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z185

Padi1, Protein-arginine deiminase type-1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi1Q9Z185 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Padi1Q9Z185 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Padi1Q9Z185 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Padi1Q9Z185 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Padi1Q9Z185 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Padi1Q9Z185 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Padi1Q9Z185 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Padi1Q9Z185 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Padi1Q9Z185 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Padi1Q9Z185 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Padi1Q9Z185 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Padi1Q9Z185 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Padi1Q9Z185 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Padi1Q9Z185 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Padi1Q9Z185 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Padi1Q9Z185 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Padi1Q9Z185 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Padi1Q9Z185 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Padi1Q9Z185 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Padi1Q9Z185 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Padi1Q9Z185 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Padi1Q9Z185 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Padi1Q9Z185 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Padi1Q9Z185 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Padi1Q9Z185 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Padi1Q9Z185 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Padi1Q9Z185 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Padi1Q9Z185 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Padi1Q9Z185 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Padi1Q9Z185 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Padi1Q9Z185 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Padi1Q9Z185 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Padi1Q9Z185 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Padi1Q9Z185 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Padi1Q9Z185 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Padi1Q9Z185 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Padi1Q9Z185 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Padi1Q9Z185 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Padi1Q9Z185 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Padi1Q9Z185 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Padi1Q9Z185 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Padi1Q9Z185 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Padi1Q9Z185 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Padi1Q9Z185 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Padi1Q9Z185 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Padi1Q9Z185 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms