Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sumo3Q9Z172 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sumo3Q9Z172 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sumo3Q9Z172 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sumo3Q9Z172 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sumo3Q9Z172 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sumo3Q9Z172 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sumo3Q9Z172 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sumo3Q9Z172 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sumo3Q9Z172 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sumo3Q9Z172 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sumo3Q9Z172 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sumo3Q9Z172 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms