Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Skp2Q9Z0Z3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Skp2Q9Z0Z3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms