Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y9

Nr1h3, Oxysterols receptor LXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h3Q9Z0Y9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nr1h3Q9Z0Y9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr1h3Q9Z0Y9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nr1h3Q9Z0Y9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr1h3Q9Z0Y9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr1h3Q9Z0Y9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr1h3Q9Z0Y9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr1h3Q9Z0Y9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nr1h3Q9Z0Y9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr1h3Q9Z0Y9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr1h3Q9Z0Y9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr1h3Q9Z0Y9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr1h3Q9Z0Y9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr1h3Q9Z0Y9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr1h3Q9Z0Y9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr1h3Q9Z0Y9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr1h3Q9Z0Y9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nr1h3Q9Z0Y9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nr1h3Q9Z0Y9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nr1h3Q9Z0Y9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms