Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pmfbp1Q9WVQ0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pmfbp1Q9WVQ0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pmfbp1Q9WVQ0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pmfbp1Q9WVQ0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pmfbp1Q9WVQ0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pmfbp1Q9WVQ0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pmfbp1Q9WVQ0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pmfbp1Q9WVQ0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pmfbp1Q9WVQ0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pmfbp1Q9WVQ0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pmfbp1Q9WVQ0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pmfbp1Q9WVQ0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pmfbp1Q9WVQ0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pmfbp1Q9WVQ0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pmfbp1Q9WVQ0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pmfbp1Q9WVQ0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pmfbp1Q9WVQ0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pmfbp1Q9WVQ0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pmfbp1Q9WVQ0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pmfbp1Q9WVQ0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pmfbp1Q9WVQ0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pmfbp1Q9WVQ0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pmfbp1Q9WVQ0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pmfbp1Q9WVQ0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pmfbp1Q9WVQ0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pmfbp1Q9WVQ0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pmfbp1Q9WVQ0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pmfbp1Q9WVQ0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pmfbp1Q9WVQ0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Pmfbp1Q9WVQ0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pmfbp1Q9WVQ0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pmfbp1Q9WVQ0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pmfbp1Q9WVQ0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pmfbp1Q9WVQ0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pmfbp1Q9WVQ0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pmfbp1Q9WVQ0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pmfbp1Q9WVQ0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pmfbp1Q9WVQ0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pmfbp1Q9WVQ0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pmfbp1Q9WVQ0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pmfbp1Q9WVQ0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pmfbp1Q9WVQ0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pmfbp1Q9WVQ0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pmfbp1Q9WVQ0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pmfbp1Q9WVQ0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pmfbp1Q9WVQ0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pmfbp1Q9WVQ0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pmfbp1Q9WVQ0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pmfbp1Q9WVQ0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pmfbp1Q9WVQ0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pmfbp1Q9WVQ0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pmfbp1Q9WVQ0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pmfbp1Q9WVQ0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pmfbp1Q9WVQ0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pmfbp1Q9WVQ0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pmfbp1Q9WVQ0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pmfbp1Q9WVQ0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pmfbp1Q9WVQ0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pmfbp1Q9WVQ0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pmfbp1Q9WVQ0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pmfbp1Q9WVQ0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pmfbp1Q9WVQ0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pmfbp1Q9WVQ0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pmfbp1Q9WVQ0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pmfbp1Q9WVQ0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pmfbp1Q9WVQ0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pmfbp1Q9WVQ0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pmfbp1Q9WVQ0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pmfbp1Q9WVQ0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pmfbp1Q9WVQ0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pmfbp1Q9WVQ0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pmfbp1Q9WVQ0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Pmfbp1Q9WVQ0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pmfbp1Q9WVQ0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pmfbp1Q9WVQ0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pmfbp1Q9WVQ0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pmfbp1Q9WVQ0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pmfbp1Q9WVQ0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pmfbp1Q9WVQ0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pmfbp1Q9WVQ0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Pmfbp1Q9WVQ0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pmfbp1Q9WVQ0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pmfbp1Q9WVQ0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pmfbp1Q9WVQ0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms