Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pacsin2Q9WVE8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pacsin2Q9WVE8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pacsin2Q9WVE8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pacsin2Q9WVE8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pacsin2Q9WVE8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pacsin2Q9WVE8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pacsin2Q9WVE8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pacsin2Q9WVE8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pacsin2Q9WVE8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pacsin2Q9WVE8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pacsin2Q9WVE8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pacsin2Q9WVE8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pacsin2Q9WVE8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pacsin2Q9WVE8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pacsin2Q9WVE8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pacsin2Q9WVE8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pacsin2Q9WVE8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pacsin2Q9WVE8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pacsin2Q9WVE8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pacsin2Q9WVE8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pacsin2Q9WVE8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pacsin2Q9WVE8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pacsin2Q9WVE8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pacsin2Q9WVE8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pacsin2Q9WVE8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pacsin2Q9WVE8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pacsin2Q9WVE8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pacsin2Q9WVE8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pacsin2Q9WVE8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pacsin2Q9WVE8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pacsin2Q9WVE8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pacsin2Q9WVE8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pacsin2Q9WVE8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pacsin2Q9WVE8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pacsin2Q9WVE8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pacsin2Q9WVE8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pacsin2Q9WVE8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pacsin2Q9WVE8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pacsin2Q9WVE8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pacsin2Q9WVE8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pacsin2Q9WVE8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pacsin2Q9WVE8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pacsin2Q9WVE8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pacsin2Q9WVE8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pacsin2Q9WVE8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pacsin2Q9WVE8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pacsin2Q9WVE8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pacsin2Q9WVE8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pacsin2Q9WVE8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pacsin2Q9WVE8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pacsin2Q9WVE8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pacsin2Q9WVE8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pacsin2Q9WVE8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pacsin2Q9WVE8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pacsin2Q9WVE8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pacsin2Q9WVE8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pacsin2Q9WVE8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pacsin2Q9WVE8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pacsin2Q9WVE8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pacsin2Q9WVE8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pacsin2Q9WVE8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pacsin2Q9WVE8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pacsin2Q9WVE8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pacsin2Q9WVE8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms