Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PplQ9R269 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PplQ9R269 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PplQ9R269 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PplQ9R269 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PplQ9R269 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PplQ9R269 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PplQ9R269 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PplQ9R269 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PplQ9R269 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PplQ9R269 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PplQ9R269 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PplQ9R269 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PplQ9R269 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PplQ9R269 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PplQ9R269 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PplQ9R269 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PplQ9R269 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
PplQ9R269 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PplQ9R269 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PplQ9R269 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PplQ9R269 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PplQ9R269 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PplQ9R269 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PplQ9R269 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PplQ9R269 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PplQ9R269 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PplQ9R269 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PplQ9R269 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PplQ9R269 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PplQ9R269 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PplQ9R269 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PplQ9R269 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PplQ9R269 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PplQ9R269 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PplQ9R269 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PplQ9R269 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PplQ9R269 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PplQ9R269 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PplQ9R269 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PplQ9R269 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PplQ9R269 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PplQ9R269 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PplQ9R269 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PplQ9R269 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PplQ9R269 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PplQ9R269 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PplQ9R269 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PplQ9R269 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PplQ9R269 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PplQ9R269 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PplQ9R269 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PplQ9R269 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PplQ9R269 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PplQ9R269 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PplQ9R269 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PplQ9R269 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PplQ9R269 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PplQ9R269 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PplQ9R269 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PplQ9R269 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PplQ9R269 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PplQ9R269 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PplQ9R269 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PplQ9R269 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PplQ9R269 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PplQ9R269 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PplQ9R269 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PplQ9R269 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PplQ9R269 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PplQ9R269 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PplQ9R269 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PplQ9R269 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PplQ9R269 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PplQ9R269 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PplQ9R269 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PplQ9R269 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PplQ9R269 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PplQ9R269 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PplQ9R269 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PplQ9R269 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PplQ9R269 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PplQ9R269 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PplQ9R269 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PplQ9R269 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PplQ9R269 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PplQ9R269 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PplQ9R269 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PplQ9R269 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PplQ9R269 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
PplQ9R269 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PplQ9R269 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PplQ9R269 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PplQ9R269 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PplQ9R269 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PplQ9R269 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PplQ9R269 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PplQ9R269 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PplQ9R269 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PplQ9R269 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms