Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sorbs3Q9R1Z8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Sorbs3Q9R1Z8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sorbs3Q9R1Z8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sorbs3Q9R1Z8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sorbs3Q9R1Z8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sorbs3Q9R1Z8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sorbs3Q9R1Z8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sorbs3Q9R1Z8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sorbs3Q9R1Z8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sorbs3Q9R1Z8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sorbs3Q9R1Z8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sorbs3Q9R1Z8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sorbs3Q9R1Z8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sorbs3Q9R1Z8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sorbs3Q9R1Z8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sorbs3Q9R1Z8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sorbs3Q9R1Z8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sorbs3Q9R1Z8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sorbs3Q9R1Z8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sorbs3Q9R1Z8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sorbs3Q9R1Z8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sorbs3Q9R1Z8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sorbs3Q9R1Z8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sorbs3Q9R1Z8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sorbs3Q9R1Z8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sorbs3Q9R1Z8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sorbs3Q9R1Z8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sorbs3Q9R1Z8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sorbs3Q9R1Z8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sorbs3Q9R1Z8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sorbs3Q9R1Z8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sorbs3Q9R1Z8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sorbs3Q9R1Z8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sorbs3Q9R1Z8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sorbs3Q9R1Z8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sorbs3Q9R1Z8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sorbs3Q9R1Z8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sorbs3Q9R1Z8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sorbs3Q9R1Z8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sorbs3Q9R1Z8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sorbs3Q9R1Z8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sorbs3Q9R1Z8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sorbs3Q9R1Z8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sorbs3Q9R1Z8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sorbs3Q9R1Z8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sorbs3Q9R1Z8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sorbs3Q9R1Z8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sorbs3Q9R1Z8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sorbs3Q9R1Z8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sorbs3Q9R1Z8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sorbs3Q9R1Z8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sorbs3Q9R1Z8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sorbs3Q9R1Z8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sorbs3Q9R1Z8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sorbs3Q9R1Z8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sorbs3Q9R1Z8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sorbs3Q9R1Z8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sorbs3Q9R1Z8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sorbs3Q9R1Z8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sorbs3Q9R1Z8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sorbs3Q9R1Z8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sorbs3Q9R1Z8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sorbs3Q9R1Z8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sorbs3Q9R1Z8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sorbs3Q9R1Z8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sorbs3Q9R1Z8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sorbs3Q9R1Z8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sorbs3Q9R1Z8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sorbs3Q9R1Z8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sorbs3Q9R1Z8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sorbs3Q9R1Z8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sorbs3Q9R1Z8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sorbs3Q9R1Z8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sorbs3Q9R1Z8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sorbs3Q9R1Z8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sorbs3Q9R1Z8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sorbs3Q9R1Z8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sorbs3Q9R1Z8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sorbs3Q9R1Z8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sorbs3Q9R1Z8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sorbs3Q9R1Z8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sorbs3Q9R1Z8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sorbs3Q9R1Z8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sorbs3Q9R1Z8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sorbs3Q9R1Z8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sorbs3Q9R1Z8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sorbs3Q9R1Z8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sorbs3Q9R1Z8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sorbs3Q9R1Z8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sorbs3Q9R1Z8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sorbs3Q9R1Z8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sorbs3Q9R1Z8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sorbs3Q9R1Z8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sorbs3Q9R1Z8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sorbs3Q9R1Z8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sorbs3Q9R1Z8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sorbs3Q9R1Z8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sorbs3Q9R1Z8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms