Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1W3

Rnf103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf103Q9R1W3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf103Q9R1W3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf103Q9R1W3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf103Q9R1W3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf103Q9R1W3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf103Q9R1W3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf103Q9R1W3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf103Q9R1W3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rnf103Q9R1W3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf103Q9R1W3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf103Q9R1W3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf103Q9R1W3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf103Q9R1W3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf103Q9R1W3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf103Q9R1W3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf103Q9R1W3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf103Q9R1W3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf103Q9R1W3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf103Q9R1W3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf103Q9R1W3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf103Q9R1W3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf103Q9R1W3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf103Q9R1W3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf103Q9R1W3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf103Q9R1W3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf103Q9R1W3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf103Q9R1W3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf103Q9R1W3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf103Q9R1W3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf103Q9R1W3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf103Q9R1W3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf103Q9R1W3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf103Q9R1W3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf103Q9R1W3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf103Q9R1W3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf103Q9R1W3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf103Q9R1W3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf103Q9R1W3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf103Q9R1W3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf103Q9R1W3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf103Q9R1W3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf103Q9R1W3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf103Q9R1W3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf103Q9R1W3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf103Q9R1W3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf103Q9R1W3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf103Q9R1W3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf103Q9R1W3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf103Q9R1W3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf103Q9R1W3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf103Q9R1W3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rnf103Q9R1W3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms