Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zeb2Q9R0G7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zeb2Q9R0G7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Zeb2Q9R0G7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Zeb2Q9R0G7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zeb2Q9R0G7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zeb2Q9R0G7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zeb2Q9R0G7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Zeb2Q9R0G7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zeb2Q9R0G7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zeb2Q9R0G7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zeb2Q9R0G7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zeb2Q9R0G7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zeb2Q9R0G7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zeb2Q9R0G7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Zeb2Q9R0G7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Zeb2Q9R0G7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zeb2Q9R0G7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zeb2Q9R0G7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zeb2Q9R0G7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Zeb2Q9R0G7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Zeb2Q9R0G7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Zeb2Q9R0G7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Zeb2Q9R0G7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Zeb2Q9R0G7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Zeb2Q9R0G7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Zeb2Q9R0G7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Zeb2Q9R0G7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zeb2Q9R0G7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zeb2Q9R0G7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zeb2Q9R0G7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zeb2Q9R0G7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zeb2Q9R0G7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zeb2Q9R0G7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zeb2Q9R0G7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zeb2Q9R0G7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zeb2Q9R0G7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Zeb2Q9R0G7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zeb2Q9R0G7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zeb2Q9R0G7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Zeb2Q9R0G7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zeb2Q9R0G7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Zeb2Q9R0G7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Zeb2Q9R0G7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Zeb2Q9R0G7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Zeb2Q9R0G7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Zeb2Q9R0G7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Zeb2Q9R0G7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Zeb2Q9R0G7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Zeb2Q9R0G7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Zeb2Q9R0G7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Zeb2Q9R0G7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Zeb2Q9R0G7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Zeb2Q9R0G7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Zeb2Q9R0G7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zeb2Q9R0G7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zeb2Q9R0G7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zeb2Q9R0G7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zeb2Q9R0G7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zeb2Q9R0G7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zeb2Q9R0G7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zeb2Q9R0G7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zeb2Q9R0G7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zeb2Q9R0G7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Zeb2Q9R0G7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Zeb2Q9R0G7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Zeb2Q9R0G7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Zeb2Q9R0G7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Zeb2Q9R0G7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Zeb2Q9R0G7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Zeb2Q9R0G7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Zeb2Q9R0G7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Zeb2Q9R0G7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Zeb2Q9R0G7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Zeb2Q9R0G7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Zeb2Q9R0G7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Zeb2Q9R0G7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Zeb2Q9R0G7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Zeb2Q9R0G7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Zeb2Q9R0G7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Zeb2Q9R0G7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Zeb2Q9R0G7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Zeb2Q9R0G7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Zeb2Q9R0G7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Zeb2Q9R0G7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Zeb2Q9R0G7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Zeb2Q9R0G7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Zeb2Q9R0G7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zeb2Q9R0G7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zeb2Q9R0G7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zeb2Q9R0G7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zeb2Q9R0G7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zeb2Q9R0G7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zeb2Q9R0G7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Zeb2Q9R0G7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Zeb2Q9R0G7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Zeb2Q9R0G7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Zeb2Q9R0G7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Zeb2Q9R0G7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Zeb2Q9R0G7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms