Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Vav3Q9R0C8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vav3Q9R0C8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vav3Q9R0C8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vav3Q9R0C8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vav3Q9R0C8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vav3Q9R0C8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vav3Q9R0C8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vav3Q9R0C8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vav3Q9R0C8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vav3Q9R0C8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vav3Q9R0C8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Vav3Q9R0C8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Vav3Q9R0C8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vav3Q9R0C8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vav3Q9R0C8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Vav3Q9R0C8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vav3Q9R0C8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vav3Q9R0C8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vav3Q9R0C8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vav3Q9R0C8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vav3Q9R0C8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vav3Q9R0C8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vav3Q9R0C8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vav3Q9R0C8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vav3Q9R0C8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vav3Q9R0C8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vav3Q9R0C8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Vav3Q9R0C8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vav3Q9R0C8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vav3Q9R0C8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vav3Q9R0C8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vav3Q9R0C8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vav3Q9R0C8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vav3Q9R0C8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vav3Q9R0C8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vav3Q9R0C8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vav3Q9R0C8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vav3Q9R0C8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Vav3Q9R0C8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vav3Q9R0C8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vav3Q9R0C8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vav3Q9R0C8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vav3Q9R0C8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vav3Q9R0C8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vav3Q9R0C8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vav3Q9R0C8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vav3Q9R0C8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vav3Q9R0C8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vav3Q9R0C8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Vav3Q9R0C8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vav3Q9R0C8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vav3Q9R0C8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vav3Q9R0C8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vav3Q9R0C8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Vav3Q9R0C8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vav3Q9R0C8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vav3Q9R0C8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vav3Q9R0C8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vav3Q9R0C8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vav3Q9R0C8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Vav3Q9R0C8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vav3Q9R0C8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vav3Q9R0C8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Vav3Q9R0C8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vav3Q9R0C8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vav3Q9R0C8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vav3Q9R0C8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vav3Q9R0C8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vav3Q9R0C8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Vav3Q9R0C8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vav3Q9R0C8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vav3Q9R0C8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vav3Q9R0C8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vav3Q9R0C8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vav3Q9R0C8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vav3Q9R0C8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vav3Q9R0C8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vav3Q9R0C8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vav3Q9R0C8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vav3Q9R0C8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vav3Q9R0C8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vav3Q9R0C8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vav3Q9R0C8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vav3Q9R0C8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vav3Q9R0C8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vav3Q9R0C8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vav3Q9R0C8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vav3Q9R0C8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vav3Q9R0C8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vav3Q9R0C8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vav3Q9R0C8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Vav3Q9R0C8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vav3Q9R0C8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Vav3Q9R0C8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Vav3Q9R0C8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vav3Q9R0C8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vav3Q9R0C8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vav3Q9R0C8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vav3Q9R0C8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms