Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copg1Q9QZE5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copg1Q9QZE5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copg1Q9QZE5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Copg1Q9QZE5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Copg1Q9QZE5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Copg1Q9QZE5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Copg1Q9QZE5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Copg1Q9QZE5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Copg1Q9QZE5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Copg1Q9QZE5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Copg1Q9QZE5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Copg1Q9QZE5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Copg1Q9QZE5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Copg1Q9QZE5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Copg1Q9QZE5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Copg1Q9QZE5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Copg1Q9QZE5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copg1Q9QZE5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copg1Q9QZE5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copg1Q9QZE5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copg1Q9QZE5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Copg1Q9QZE5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copg1Q9QZE5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copg1Q9QZE5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copg1Q9QZE5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copg1Q9QZE5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copg1Q9QZE5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copg1Q9QZE5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copg1Q9QZE5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copg1Q9QZE5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copg1Q9QZE5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Copg1Q9QZE5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copg1Q9QZE5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Copg1Q9QZE5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Copg1Q9QZE5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Copg1Q9QZE5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Copg1Q9QZE5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Copg1Q9QZE5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Copg1Q9QZE5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Copg1Q9QZE5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Copg1Q9QZE5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Copg1Q9QZE5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Copg1Q9QZE5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Copg1Q9QZE5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Copg1Q9QZE5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Copg1Q9QZE5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Copg1Q9QZE5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Copg1Q9QZE5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Copg1Q9QZE5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms