Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hacd1Q9QY80 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hacd1Q9QY80 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hacd1Q9QY80 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hacd1Q9QY80 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms