Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
VapbQ9QY76 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VapbQ9QY76 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms