Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Psma6Q9QUM9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Psma6Q9QUM9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Psma6Q9QUM9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psma6Q9QUM9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psma6Q9QUM9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psma6Q9QUM9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psma6Q9QUM9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psma6Q9QUM9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psma6Q9QUM9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psma6Q9QUM9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psma6Q9QUM9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psma6Q9QUM9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psma6Q9QUM9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psma6Q9QUM9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psma6Q9QUM9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psma6Q9QUM9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psma6Q9QUM9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psma6Q9QUM9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psma6Q9QUM9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psma6Q9QUM9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psma6Q9QUM9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Psma6Q9QUM9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psma6Q9QUM9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psma6Q9QUM9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psma6Q9QUM9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psma6Q9QUM9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psma6Q9QUM9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psma6Q9QUM9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psma6Q9QUM9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psma6Q9QUM9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psma6Q9QUM9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psma6Q9QUM9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psma6Q9QUM9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms