Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ0

Litaf, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor homolog, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LitafQ9JLJ0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LitafQ9JLJ0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LitafQ9JLJ0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LitafQ9JLJ0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LitafQ9JLJ0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LitafQ9JLJ0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LitafQ9JLJ0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LitafQ9JLJ0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LitafQ9JLJ0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LitafQ9JLJ0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LitafQ9JLJ0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LitafQ9JLJ0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LitafQ9JLJ0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LitafQ9JLJ0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LitafQ9JLJ0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LitafQ9JLJ0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LitafQ9JLJ0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LitafQ9JLJ0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LitafQ9JLJ0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LitafQ9JLJ0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LitafQ9JLJ0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LitafQ9JLJ0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LitafQ9JLJ0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LitafQ9JLJ0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LitafQ9JLJ0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LitafQ9JLJ0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LitafQ9JLJ0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LitafQ9JLJ0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LitafQ9JLJ0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LitafQ9JLJ0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LitafQ9JLJ0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LitafQ9JLJ0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms