Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkd2l2Q9JLG4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkd2l2Q9JLG4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkd2l2Q9JLG4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkd2l2Q9JLG4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkd2l2Q9JLG4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkd2l2Q9JLG4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkd2l2Q9JLG4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkd2l2Q9JLG4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkd2l2Q9JLG4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkd2l2Q9JLG4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkd2l2Q9JLG4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkd2l2Q9JLG4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkd2l2Q9JLG4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkd2l2Q9JLG4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkd2l2Q9JLG4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkd2l2Q9JLG4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkd2l2Q9JLG4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pkd2l2Q9JLG4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pkd2l2Q9JLG4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pkd2l2Q9JLG4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pkd2l2Q9JLG4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pkd2l2Q9JLG4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pkd2l2Q9JLG4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pkd2l2Q9JLG4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pkd2l2Q9JLG4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pkd2l2Q9JLG4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkd2l2Q9JLG4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkd2l2Q9JLG4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkd2l2Q9JLG4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkd2l2Q9JLG4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkd2l2Q9JLG4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkd2l2Q9JLG4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkd2l2Q9JLG4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkd2l2Q9JLG4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Pkd2l2Q9JLG4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pkd2l2Q9JLG4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pkd2l2Q9JLG4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pkd2l2Q9JLG4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pkd2l2Q9JLG4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkd2l2Q9JLG4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkd2l2Q9JLG4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkd2l2Q9JLG4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkd2l2Q9JLG4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkd2l2Q9JLG4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkd2l2Q9JLG4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkd2l2Q9JLG4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pkd2l2Q9JLG4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pkd2l2Q9JLG4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pkd2l2Q9JLG4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pkd2l2Q9JLG4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pkd2l2Q9JLG4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pkd2l2Q9JLG4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pkd2l2Q9JLG4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkd2l2Q9JLG4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkd2l2Q9JLG4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pkd2l2Q9JLG4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pkd2l2Q9JLG4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pkd2l2Q9JLG4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pkd2l2Q9JLG4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pkd2l2Q9JLG4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkd2l2Q9JLG4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkd2l2Q9JLG4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkd2l2Q9JLG4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pkd2l2Q9JLG4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pkd2l2Q9JLG4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pkd2l2Q9JLG4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pkd2l2Q9JLG4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pkd2l2Q9JLG4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pkd2l2Q9JLG4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pkd2l2Q9JLG4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pkd2l2Q9JLG4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pkd2l2Q9JLG4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pkd2l2Q9JLG4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pkd2l2Q9JLG4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pkd2l2Q9JLG4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pkd2l2Q9JLG4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pkd2l2Q9JLG4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pkd2l2Q9JLG4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms