Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKZ2

Slc5a3, Sodium/myo-inositol cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a3Q9JKZ2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc5a3Q9JKZ2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc5a3Q9JKZ2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc5a3Q9JKZ2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc5a3Q9JKZ2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc5a3Q9JKZ2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc5a3Q9JKZ2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc5a3Q9JKZ2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc5a3Q9JKZ2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc5a3Q9JKZ2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc5a3Q9JKZ2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc5a3Q9JKZ2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc5a3Q9JKZ2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc5a3Q9JKZ2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc5a3Q9JKZ2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc5a3Q9JKZ2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc5a3Q9JKZ2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc5a3Q9JKZ2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc5a3Q9JKZ2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc5a3Q9JKZ2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc5a3Q9JKZ2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc5a3Q9JKZ2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc5a3Q9JKZ2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc5a3Q9JKZ2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc5a3Q9JKZ2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc5a3Q9JKZ2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc5a3Q9JKZ2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc5a3Q9JKZ2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc5a3Q9JKZ2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc5a3Q9JKZ2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc5a3Q9JKZ2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc5a3Q9JKZ2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc5a3Q9JKZ2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc5a3Q9JKZ2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc5a3Q9JKZ2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc5a3Q9JKZ2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Slc5a3Q9JKZ2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Slc5a3Q9JKZ2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Slc5a3Q9JKZ2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Slc5a3Q9JKZ2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Slc5a3Q9JKZ2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc5a3Q9JKZ2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc5a3Q9JKZ2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc5a3Q9JKZ2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc5a3Q9JKZ2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc5a3Q9JKZ2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc5a3Q9JKZ2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc5a3Q9JKZ2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc5a3Q9JKZ2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Slc5a3Q9JKZ2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Slc5a3Q9JKZ2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Slc5a3Q9JKZ2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Slc5a3Q9JKZ2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Slc5a3Q9JKZ2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Slc5a3Q9JKZ2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Slc5a3Q9JKZ2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Slc5a3Q9JKZ2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Slc5a3Q9JKZ2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Slc5a3Q9JKZ2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Slc5a3Q9JKZ2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Slc5a3Q9JKZ2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Slc5a3Q9JKZ2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Slc5a3Q9JKZ2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Slc5a3Q9JKZ2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Slc5a3Q9JKZ2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Slc5a3Q9JKZ2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Slc5a3Q9JKZ2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Slc5a3Q9JKZ2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Slc5a3Q9JKZ2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Slc5a3Q9JKZ2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Slc5a3Q9JKZ2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Slc5a3Q9JKZ2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Slc5a3Q9JKZ2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Slc5a3Q9JKZ2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Slc5a3Q9JKZ2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Slc5a3Q9JKZ2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Slc5a3Q9JKZ2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Slc5a3Q9JKZ2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Slc5a3Q9JKZ2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Slc5a3Q9JKZ2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Slc5a3Q9JKZ2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Slc5a3Q9JKZ2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Slc5a3Q9JKZ2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Slc5a3Q9JKZ2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Slc5a3Q9JKZ2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Slc5a3Q9JKZ2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Slc5a3Q9JKZ2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Slc5a3Q9JKZ2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Slc5a3Q9JKZ2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Slc5a3Q9JKZ2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Slc5a3Q9JKZ2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Slc5a3Q9JKZ2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Slc5a3Q9JKZ2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Slc5a3Q9JKZ2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Slc5a3Q9JKZ2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms