Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Irx5Q9JKQ4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx5Q9JKQ4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx5Q9JKQ4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx5Q9JKQ4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx5Q9JKQ4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx5Q9JKQ4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx5Q9JKQ4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx5Q9JKQ4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx5Q9JKQ4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx5Q9JKQ4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx5Q9JKQ4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irx5Q9JKQ4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx5Q9JKQ4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx5Q9JKQ4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx5Q9JKQ4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irx5Q9JKQ4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irx5Q9JKQ4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irx5Q9JKQ4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irx5Q9JKQ4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irx5Q9JKQ4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irx5Q9JKQ4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irx5Q9JKQ4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irx5Q9JKQ4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irx5Q9JKQ4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irx5Q9JKQ4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irx5Q9JKQ4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irx5Q9JKQ4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irx5Q9JKQ4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irx5Q9JKQ4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irx5Q9JKQ4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irx5Q9JKQ4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irx5Q9JKQ4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irx5Q9JKQ4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Irx5Q9JKQ4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irx5Q9JKQ4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irx5Q9JKQ4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Irx5Q9JKQ4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Irx5Q9JKQ4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Irx5Q9JKQ4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Irx5Q9JKQ4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Irx5Q9JKQ4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Irx5Q9JKQ4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Irx5Q9JKQ4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Irx5Q9JKQ4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irx5Q9JKQ4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irx5Q9JKQ4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irx5Q9JKQ4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Irx5Q9JKQ4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Irx5Q9JKQ4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irx5Q9JKQ4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irx5Q9JKQ4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx5Q9JKQ4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx5Q9JKQ4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx5Q9JKQ4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx5Q9JKQ4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx5Q9JKQ4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx5Q9JKQ4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx5Q9JKQ4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx5Q9JKQ4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irx5Q9JKQ4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx5Q9JKQ4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx5Q9JKQ4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irx5Q9JKQ4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms