Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trem1Q9JKE2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trem1Q9JKE2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trem1Q9JKE2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trem1Q9JKE2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trem1Q9JKE2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trem1Q9JKE2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trem1Q9JKE2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trem1Q9JKE2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trem1Q9JKE2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trem1Q9JKE2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trem1Q9JKE2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trem1Q9JKE2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trem1Q9JKE2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trem1Q9JKE2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trem1Q9JKE2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trem1Q9JKE2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Trem1Q9JKE2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trem1Q9JKE2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trem1Q9JKE2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trem1Q9JKE2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trem1Q9JKE2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trem1Q9JKE2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trem1Q9JKE2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trem1Q9JKE2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trem1Q9JKE2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trem1Q9JKE2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trem1Q9JKE2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trem1Q9JKE2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trem1Q9JKE2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trem1Q9JKE2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trem1Q9JKE2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trem1Q9JKE2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trem1Q9JKE2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trem1Q9JKE2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trem1Q9JKE2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trem1Q9JKE2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trem1Q9JKE2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trem1Q9JKE2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trem1Q9JKE2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trem1Q9JKE2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trem1Q9JKE2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trem1Q9JKE2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trem1Q9JKE2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trem1Q9JKE2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trem1Q9JKE2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trem1Q9JKE2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trem1Q9JKE2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trem1Q9JKE2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.8 ms