Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uchl3Q9JKB1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uchl3Q9JKB1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uchl3Q9JKB1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uchl3Q9JKB1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uchl3Q9JKB1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uchl3Q9JKB1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uchl3Q9JKB1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uchl3Q9JKB1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uchl3Q9JKB1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uchl3Q9JKB1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uchl3Q9JKB1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uchl3Q9JKB1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uchl3Q9JKB1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uchl3Q9JKB1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uchl3Q9JKB1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uchl3Q9JKB1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uchl3Q9JKB1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Uchl3Q9JKB1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Uchl3Q9JKB1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uchl3Q9JKB1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uchl3Q9JKB1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uchl3Q9JKB1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uchl3Q9JKB1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uchl3Q9JKB1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uchl3Q9JKB1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uchl3Q9JKB1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uchl3Q9JKB1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Uchl3Q9JKB1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uchl3Q9JKB1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uchl3Q9JKB1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uchl3Q9JKB1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uchl3Q9JKB1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Uchl3Q9JKB1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Uchl3Q9JKB1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Uchl3Q9JKB1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uchl3Q9JKB1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms