Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJV4

Cacng4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng4Q9JJV4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacng4Q9JJV4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacng4Q9JJV4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacng4Q9JJV4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacng4Q9JJV4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacng4Q9JJV4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacng4Q9JJV4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacng4Q9JJV4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacng4Q9JJV4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacng4Q9JJV4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacng4Q9JJV4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacng4Q9JJV4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacng4Q9JJV4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacng4Q9JJV4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacng4Q9JJV4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacng4Q9JJV4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacng4Q9JJV4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacng4Q9JJV4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacng4Q9JJV4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacng4Q9JJV4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacng4Q9JJV4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacng4Q9JJV4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacng4Q9JJV4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacng4Q9JJV4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacng4Q9JJV4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacng4Q9JJV4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacng4Q9JJV4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacng4Q9JJV4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacng4Q9JJV4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacng4Q9JJV4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacng4Q9JJV4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacng4Q9JJV4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacng4Q9JJV4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacng4Q9JJV4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacng4Q9JJV4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacng4Q9JJV4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacng4Q9JJV4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacng4Q9JJV4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacng4Q9JJV4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacng4Q9JJV4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacng4Q9JJV4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacng4Q9JJV4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacng4Q9JJV4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacng4Q9JJV4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacng4Q9JJV4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacng4Q9JJV4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacng4Q9JJV4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacng4Q9JJV4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacng4Q9JJV4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacng4Q9JJV4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacng4Q9JJV4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacng4Q9JJV4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacng4Q9JJV4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacng4Q9JJV4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacng4Q9JJV4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacng4Q9JJV4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacng4Q9JJV4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacng4Q9JJV4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacng4Q9JJV4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacng4Q9JJV4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacng4Q9JJV4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacng4Q9JJV4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacng4Q9JJV4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacng4Q9JJV4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacng4Q9JJV4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacng4Q9JJV4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacng4Q9JJV4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cacng4Q9JJV4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacng4Q9JJV4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacng4Q9JJV4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacng4Q9JJV4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacng4Q9JJV4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacng4Q9JJV4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacng4Q9JJV4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacng4Q9JJV4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacng4Q9JJV4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacng4Q9JJV4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacng4Q9JJV4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacng4Q9JJV4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacng4Q9JJV4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacng4Q9JJV4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacng4Q9JJV4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacng4Q9JJV4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacng4Q9JJV4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacng4Q9JJV4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacng4Q9JJV4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacng4Q9JJV4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacng4Q9JJV4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacng4Q9JJV4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacng4Q9JJV4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacng4Q9JJV4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacng4Q9JJV4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacng4Q9JJV4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacng4Q9JJV4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacng4Q9JJV4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacng4Q9JJV4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacng4Q9JJV4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacng4Q9JJV4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacng4Q9JJV4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacng4Q9JJV4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.5 ms