Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmbr1Q9JIT0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmbr1Q9JIT0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmbr1Q9JIT0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmbr1Q9JIT0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmbr1Q9JIT0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmbr1Q9JIT0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmbr1Q9JIT0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmbr1Q9JIT0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmbr1Q9JIT0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmbr1Q9JIT0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmbr1Q9JIT0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmbr1Q9JIT0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmbr1Q9JIT0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmbr1Q9JIT0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmbr1Q9JIT0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmbr1Q9JIT0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmbr1Q9JIT0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmbr1Q9JIT0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmbr1Q9JIT0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmbr1Q9JIT0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmbr1Q9JIT0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmbr1Q9JIT0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmbr1Q9JIT0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmbr1Q9JIT0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmbr1Q9JIT0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmbr1Q9JIT0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmbr1Q9JIT0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmbr1Q9JIT0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmbr1Q9JIT0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmbr1Q9JIT0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmbr1Q9JIT0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmbr1Q9JIT0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmbr1Q9JIT0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmbr1Q9JIT0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmbr1Q9JIT0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmbr1Q9JIT0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmbr1Q9JIT0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmbr1Q9JIT0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmbr1Q9JIT0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmbr1Q9JIT0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmbr1Q9JIT0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmbr1Q9JIT0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmbr1Q9JIT0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmbr1Q9JIT0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmbr1Q9JIT0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmbr1Q9JIT0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lmbr1Q9JIT0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lmbr1Q9JIT0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lmbr1Q9JIT0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lmbr1Q9JIT0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lmbr1Q9JIT0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lmbr1Q9JIT0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Lmbr1Q9JIT0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms