Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIH2

Nup50, Nuclear pore complex protein Nup50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup50Q9JIH2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup50Q9JIH2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup50Q9JIH2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup50Q9JIH2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup50Q9JIH2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup50Q9JIH2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup50Q9JIH2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup50Q9JIH2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup50Q9JIH2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup50Q9JIH2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup50Q9JIH2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup50Q9JIH2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup50Q9JIH2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup50Q9JIH2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup50Q9JIH2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup50Q9JIH2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup50Q9JIH2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup50Q9JIH2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup50Q9JIH2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup50Q9JIH2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup50Q9JIH2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms