Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW4

Eefsec, Selenocysteine-specific elongation factor, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EefsecQ9JHW4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EefsecQ9JHW4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EefsecQ9JHW4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EefsecQ9JHW4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EefsecQ9JHW4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EefsecQ9JHW4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EefsecQ9JHW4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EefsecQ9JHW4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EefsecQ9JHW4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EefsecQ9JHW4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EefsecQ9JHW4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EefsecQ9JHW4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EefsecQ9JHW4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EefsecQ9JHW4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EefsecQ9JHW4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EefsecQ9JHW4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EefsecQ9JHW4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EefsecQ9JHW4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EefsecQ9JHW4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EefsecQ9JHW4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EefsecQ9JHW4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EefsecQ9JHW4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EefsecQ9JHW4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EefsecQ9JHW4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EefsecQ9JHW4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EefsecQ9JHW4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EefsecQ9JHW4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EefsecQ9JHW4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EefsecQ9JHW4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EefsecQ9JHW4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EefsecQ9JHW4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EefsecQ9JHW4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EefsecQ9JHW4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EefsecQ9JHW4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EefsecQ9JHW4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EefsecQ9JHW4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EefsecQ9JHW4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EefsecQ9JHW4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EefsecQ9JHW4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EefsecQ9JHW4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EefsecQ9JHW4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EefsecQ9JHW4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EefsecQ9JHW4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EefsecQ9JHW4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EefsecQ9JHW4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EefsecQ9JHW4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EefsecQ9JHW4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EefsecQ9JHW4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EefsecQ9JHW4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EefsecQ9JHW4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EefsecQ9JHW4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EefsecQ9JHW4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EefsecQ9JHW4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EefsecQ9JHW4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EefsecQ9JHW4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
EefsecQ9JHW4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EefsecQ9JHW4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EefsecQ9JHW4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EefsecQ9JHW4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EefsecQ9JHW4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EefsecQ9JHW4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EefsecQ9JHW4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EefsecQ9JHW4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EefsecQ9JHW4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EefsecQ9JHW4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EefsecQ9JHW4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EefsecQ9JHW4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EefsecQ9JHW4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EefsecQ9JHW4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EefsecQ9JHW4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EefsecQ9JHW4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EefsecQ9JHW4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EefsecQ9JHW4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EefsecQ9JHW4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EefsecQ9JHW4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
EefsecQ9JHW4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EefsecQ9JHW4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EefsecQ9JHW4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EefsecQ9JHW4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EefsecQ9JHW4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EefsecQ9JHW4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EefsecQ9JHW4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EefsecQ9JHW4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EefsecQ9JHW4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EefsecQ9JHW4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EefsecQ9JHW4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
EefsecQ9JHW4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
EefsecQ9JHW4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EefsecQ9JHW4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
EefsecQ9JHW4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
EefsecQ9JHW4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EefsecQ9JHW4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EefsecQ9JHW4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EefsecQ9JHW4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EefsecQ9JHW4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EefsecQ9JHW4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EefsecQ9JHW4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EefsecQ9JHW4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EefsecQ9JHW4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EefsecQ9JHW4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms