Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcirg1Q9JHF5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcirg1Q9JHF5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcirg1Q9JHF5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcirg1Q9JHF5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcirg1Q9JHF5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcirg1Q9JHF5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcirg1Q9JHF5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcirg1Q9JHF5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcirg1Q9JHF5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcirg1Q9JHF5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcirg1Q9JHF5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcirg1Q9JHF5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcirg1Q9JHF5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcirg1Q9JHF5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tcirg1Q9JHF5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcirg1Q9JHF5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcirg1Q9JHF5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcirg1Q9JHF5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcirg1Q9JHF5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcirg1Q9JHF5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcirg1Q9JHF5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcirg1Q9JHF5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcirg1Q9JHF5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcirg1Q9JHF5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcirg1Q9JHF5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcirg1Q9JHF5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcirg1Q9JHF5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcirg1Q9JHF5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcirg1Q9JHF5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcirg1Q9JHF5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcirg1Q9JHF5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcirg1Q9JHF5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcirg1Q9JHF5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcirg1Q9JHF5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcirg1Q9JHF5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcirg1Q9JHF5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcirg1Q9JHF5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcirg1Q9JHF5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcirg1Q9JHF5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcirg1Q9JHF5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcirg1Q9JHF5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcirg1Q9JHF5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcirg1Q9JHF5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcirg1Q9JHF5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcirg1Q9JHF5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcirg1Q9JHF5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcirg1Q9JHF5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcirg1Q9JHF5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcirg1Q9JHF5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcirg1Q9JHF5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcirg1Q9JHF5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcirg1Q9JHF5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcirg1Q9JHF5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcirg1Q9JHF5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcirg1Q9JHF5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.4 ms