Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn12Q9ET43 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn12Q9ET43 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn12Q9ET43 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn12Q9ET43 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn12Q9ET43 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn12Q9ET43 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn12Q9ET43 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn12Q9ET43 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn12Q9ET43 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn12Q9ET43 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn12Q9ET43 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn12Q9ET43 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn12Q9ET43 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn12Q9ET43 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn12Q9ET43 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn12Q9ET43 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn12Q9ET43 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn12Q9ET43 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn12Q9ET43 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn12Q9ET43 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn12Q9ET43 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn12Q9ET43 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn12Q9ET43 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn12Q9ET43 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn12Q9ET43 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn12Q9ET43 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn12Q9ET43 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn12Q9ET43 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn12Q9ET43 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn12Q9ET43 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn12Q9ET43 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn12Q9ET43 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn12Q9ET43 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn12Q9ET43 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn12Q9ET43 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn12Q9ET43 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn12Q9ET43 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn12Q9ET43 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn12Q9ET43 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn12Q9ET43 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn12Q9ET43 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn12Q9ET43 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn12Q9ET43 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn12Q9ET43 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn12Q9ET43 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn12Q9ET43 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn12Q9ET43 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn12Q9ET43 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn12Q9ET43 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn12Q9ET43 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn12Q9ET43 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn12Q9ET43 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn12Q9ET43 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn12Q9ET43 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn12Q9ET43 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn12Q9ET43 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn12Q9ET43 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn12Q9ET43 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn12Q9ET43 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn12Q9ET43 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn12Q9ET43 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn12Q9ET43 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn12Q9ET43 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn12Q9ET43 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn12Q9ET43 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn12Q9ET43 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn12Q9ET43 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn12Q9ET43 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn12Q9ET43 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn12Q9ET43 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn12Q9ET43 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn12Q9ET43 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn12Q9ET43 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn12Q9ET43 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn12Q9ET43 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn12Q9ET43 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn12Q9ET43 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn12Q9ET43 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn12Q9ET43 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn12Q9ET43 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms