Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET35

Tnfrsf13b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13bQ9ET35 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfrsf13bQ9ET35 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms