Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESJ4

Nckipsd, NCK-interacting protein with SH3 domain, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NckipsdQ9ESJ4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NckipsdQ9ESJ4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NckipsdQ9ESJ4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NckipsdQ9ESJ4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NckipsdQ9ESJ4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NckipsdQ9ESJ4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NckipsdQ9ESJ4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NckipsdQ9ESJ4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NckipsdQ9ESJ4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NckipsdQ9ESJ4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NckipsdQ9ESJ4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NckipsdQ9ESJ4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NckipsdQ9ESJ4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NckipsdQ9ESJ4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NckipsdQ9ESJ4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NckipsdQ9ESJ4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NckipsdQ9ESJ4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NckipsdQ9ESJ4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NckipsdQ9ESJ4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NckipsdQ9ESJ4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NckipsdQ9ESJ4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NckipsdQ9ESJ4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NckipsdQ9ESJ4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NckipsdQ9ESJ4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NckipsdQ9ESJ4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NckipsdQ9ESJ4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NckipsdQ9ESJ4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NckipsdQ9ESJ4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NckipsdQ9ESJ4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NckipsdQ9ESJ4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NckipsdQ9ESJ4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NckipsdQ9ESJ4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NckipsdQ9ESJ4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NckipsdQ9ESJ4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NckipsdQ9ESJ4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NckipsdQ9ESJ4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NckipsdQ9ESJ4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NckipsdQ9ESJ4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NckipsdQ9ESJ4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NckipsdQ9ESJ4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NckipsdQ9ESJ4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NckipsdQ9ESJ4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NckipsdQ9ESJ4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NckipsdQ9ESJ4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NckipsdQ9ESJ4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NckipsdQ9ESJ4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NckipsdQ9ESJ4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NckipsdQ9ESJ4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NckipsdQ9ESJ4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms