Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Wdr61Q9ERF3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Wdr61Q9ERF3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Wdr61Q9ERF3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Wdr61Q9ERF3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Wdr61Q9ERF3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Wdr61Q9ERF3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Wdr61Q9ERF3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Wdr61Q9ERF3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Wdr61Q9ERF3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Wdr61Q9ERF3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Wdr61Q9ERF3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Wdr61Q9ERF3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Wdr61Q9ERF3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Wdr61Q9ERF3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Wdr61Q9ERF3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Wdr61Q9ERF3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Wdr61Q9ERF3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Wdr61Q9ERF3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Wdr61Q9ERF3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Wdr61Q9ERF3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr61Q9ERF3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr61Q9ERF3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr61Q9ERF3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr61Q9ERF3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr61Q9ERF3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr61Q9ERF3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr61Q9ERF3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr61Q9ERF3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr61Q9ERF3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr61Q9ERF3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr61Q9ERF3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr61Q9ERF3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr61Q9ERF3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr61Q9ERF3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdr61Q9ERF3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdr61Q9ERF3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdr61Q9ERF3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdr61Q9ERF3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdr61Q9ERF3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Wdr61Q9ERF3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Wdr61Q9ERF3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Wdr61Q9ERF3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Wdr61Q9ERF3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Wdr61Q9ERF3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms