Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP53

Tsc1, Hamartin, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc1Q9EP53 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tsc1Q9EP53 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tsc1Q9EP53 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tsc1Q9EP53 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tsc1Q9EP53 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tsc1Q9EP53 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tsc1Q9EP53 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tsc1Q9EP53 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsc1Q9EP53 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsc1Q9EP53 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsc1Q9EP53 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsc1Q9EP53 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsc1Q9EP53 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsc1Q9EP53 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsc1Q9EP53 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsc1Q9EP53 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsc1Q9EP53 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsc1Q9EP53 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tsc1Q9EP53 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tsc1Q9EP53 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tsc1Q9EP53 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tsc1Q9EP53 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tsc1Q9EP53 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tsc1Q9EP53 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Tsc1Q9EP53 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tsc1Q9EP53 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tsc1Q9EP53 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tsc1Q9EP53 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tsc1Q9EP53 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tsc1Q9EP53 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tsc1Q9EP53 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tsc1Q9EP53 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tsc1Q9EP53 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tsc1Q9EP53 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tsc1Q9EP53 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tsc1Q9EP53 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tsc1Q9EP53 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tsc1Q9EP53 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tsc1Q9EP53 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tsc1Q9EP53 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tsc1Q9EP53 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tsc1Q9EP53 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tsc1Q9EP53 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tsc1Q9EP53 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tsc1Q9EP53 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tsc1Q9EP53 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tsc1Q9EP53 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tsc1Q9EP53 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tsc1Q9EP53 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tsc1Q9EP53 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tsc1Q9EP53 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tsc1Q9EP53 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tsc1Q9EP53 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tsc1Q9EP53 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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Tsc1Q9EP53 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tsc1Q9EP53 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tsc1Q9EP53 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tsc1Q9EP53 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tsc1Q9EP53 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tsc1Q9EP53 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tsc1Q9EP53 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tsc1Q9EP53 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tsc1Q9EP53 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tsc1Q9EP53 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tsc1Q9EP53 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tsc1Q9EP53 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tsc1Q9EP53 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tsc1Q9EP53 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tsc1Q9EP53 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tsc1Q9EP53 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tsc1Q9EP53 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tsc1Q9EP53 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tsc1Q9EP53 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tsc1Q9EP53 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tsc1Q9EP53 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tsc1Q9EP53 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tsc1Q9EP53 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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Tsc1Q9EP53 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tsc1Q9EP53 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tsc1Q9EP53 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tsc1Q9EP53 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tsc1Q9EP53 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tsc1Q9EP53 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tsc1Q9EP53 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tsc1Q9EP53 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tsc1Q9EP53 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tsc1Q9EP53 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tsc1Q9EP53 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tsc1Q9EP53 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tsc1Q9EP53 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tsc1Q9EP53 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tsc1Q9EP53 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tsc1Q9EP53 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tsc1Q9EP53 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tsc1Q9EP53 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tsc1Q9EP53 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tsc1Q9EP53 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms