Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl4Q9DCU6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl4Q9DCU6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl4Q9DCU6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl4Q9DCU6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl4Q9DCU6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl4Q9DCU6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl4Q9DCU6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl4Q9DCU6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl4Q9DCU6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl4Q9DCU6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl4Q9DCU6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl4Q9DCU6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Mrpl4Q9DCU6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mrpl4Q9DCU6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Mrpl4Q9DCU6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mrpl4Q9DCU6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Mrpl4Q9DCU6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mrpl4Q9DCU6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mrpl4Q9DCU6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrpl4Q9DCU6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrpl4Q9DCU6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrpl4Q9DCU6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrpl4Q9DCU6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrpl4Q9DCU6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrpl4Q9DCU6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrpl4Q9DCU6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrpl4Q9DCU6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrpl4Q9DCU6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrpl4Q9DCU6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrpl4Q9DCU6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrpl4Q9DCU6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrpl4Q9DCU6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrpl4Q9DCU6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl4Q9DCU6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl4Q9DCU6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl4Q9DCU6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl4Q9DCU6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl4Q9DCU6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl4Q9DCU6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl4Q9DCU6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrpl4Q9DCU6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrpl4Q9DCU6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrpl4Q9DCU6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrpl4Q9DCU6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrpl4Q9DCU6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrpl4Q9DCU6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrpl4Q9DCU6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.9 ms