Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tspan4Q9DCK3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tspan4Q9DCK3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tspan4Q9DCK3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tspan4Q9DCK3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tspan4Q9DCK3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tspan4Q9DCK3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tspan4Q9DCK3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tspan4Q9DCK3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tspan4Q9DCK3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tspan4Q9DCK3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tspan4Q9DCK3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tspan4Q9DCK3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tspan4Q9DCK3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tspan4Q9DCK3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tspan4Q9DCK3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tspan4Q9DCK3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tspan4Q9DCK3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tspan4Q9DCK3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tspan4Q9DCK3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tspan4Q9DCK3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tspan4Q9DCK3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tspan4Q9DCK3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tspan4Q9DCK3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tspan4Q9DCK3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tspan4Q9DCK3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tspan4Q9DCK3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan4Q9DCK3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan4Q9DCK3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan4Q9DCK3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan4Q9DCK3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan4Q9DCK3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan4Q9DCK3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan4Q9DCK3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan4Q9DCK3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan4Q9DCK3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tspan4Q9DCK3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tspan4Q9DCK3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tspan4Q9DCK3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tspan4Q9DCK3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tspan4Q9DCK3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tspan4Q9DCK3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tspan4Q9DCK3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tspan4Q9DCK3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms