Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Med27Q9DB40 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Med27Q9DB40 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Med27Q9DB40 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Med27Q9DB40 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Med27Q9DB40 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Med27Q9DB40 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Med27Q9DB40 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Med27Q9DB40 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Med27Q9DB40 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Med27Q9DB40 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Med27Q9DB40 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Med27Q9DB40 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Med27Q9DB40 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Med27Q9DB40 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Med27Q9DB40 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Med27Q9DB40 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med27Q9DB40 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med27Q9DB40 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med27Q9DB40 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med27Q9DB40 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med27Q9DB40 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med27Q9DB40 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med27Q9DB40 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med27Q9DB40 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med27Q9DB40 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Med27Q9DB40 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med27Q9DB40 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med27Q9DB40 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med27Q9DB40 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med27Q9DB40 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med27Q9DB40 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med27Q9DB40 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med27Q9DB40 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med27Q9DB40 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med27Q9DB40 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med27Q9DB40 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med27Q9DB40 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Med27Q9DB40 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Med27Q9DB40 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med27Q9DB40 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med27Q9DB40 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med27Q9DB40 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med27Q9DB40 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med27Q9DB40 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med27Q9DB40 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med27Q9DB40 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med27Q9DB40 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med27Q9DB40 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med27Q9DB40 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med27Q9DB40 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med27Q9DB40 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med27Q9DB40 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med27Q9DB40 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med27Q9DB40 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med27Q9DB40 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med27Q9DB40 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Med27Q9DB40 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Med27Q9DB40 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Med27Q9DB40 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Med27Q9DB40 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Med27Q9DB40 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Med27Q9DB40 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Med27Q9DB40 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Med27Q9DB40 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Med27Q9DB40 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Med27Q9DB40 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Med27Q9DB40 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Med27Q9DB40 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Med27Q9DB40 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Med27Q9DB40 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Med27Q9DB40 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Med27Q9DB40 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Med27Q9DB40 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Med27Q9DB40 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Med27Q9DB40 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Med27Q9DB40 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Med27Q9DB40 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Med27Q9DB40 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Med27Q9DB40 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Med27Q9DB40 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Med27Q9DB40 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Med27Q9DB40 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Med27Q9DB40 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Med27Q9DB40 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Med27Q9DB40 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Med27Q9DB40 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Med27Q9DB40 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Med27Q9DB40 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Med27Q9DB40 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Med27Q9DB40 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Med27Q9DB40 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Med27Q9DB40 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Med27Q9DB40 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Med27Q9DB40 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Med27Q9DB40 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Med27Q9DB40 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Med27Q9DB40 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Med27Q9DB40 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Med27Q9DB40 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms