Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB10

Smdt1, Essential MCU regulator, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smdt1Q9DB10 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Smdt1Q9DB10 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smdt1Q9DB10 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smdt1Q9DB10 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smdt1Q9DB10 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smdt1Q9DB10 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smdt1Q9DB10 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smdt1Q9DB10 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smdt1Q9DB10 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smdt1Q9DB10 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smdt1Q9DB10 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smdt1Q9DB10 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smdt1Q9DB10 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smdt1Q9DB10 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smdt1Q9DB10 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smdt1Q9DB10 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smdt1Q9DB10 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smdt1Q9DB10 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smdt1Q9DB10 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smdt1Q9DB10 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smdt1Q9DB10 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smdt1Q9DB10 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.8 ms