Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAR1

Cmtm2a, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2aQ9DAR1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtm2aQ9DAR1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtm2aQ9DAR1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cmtm2aQ9DAR1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Cmtm2aQ9DAR1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm2aQ9DAR1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm2aQ9DAR1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm2aQ9DAR1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm2aQ9DAR1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm2aQ9DAR1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm2aQ9DAR1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm2aQ9DAR1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm2aQ9DAR1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cmtm2aQ9DAR1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm2aQ9DAR1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm2aQ9DAR1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm2aQ9DAR1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm2aQ9DAR1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm2aQ9DAR1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm2aQ9DAR1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm2aQ9DAR1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm2aQ9DAR1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cmtm2aQ9DAR1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm2aQ9DAR1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm2aQ9DAR1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm2aQ9DAR1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm2aQ9DAR1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm2aQ9DAR1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm2aQ9DAR1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cmtm2aQ9DAR1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm2aQ9DAR1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm2aQ9DAR1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm2aQ9DAR1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm2aQ9DAR1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm2aQ9DAR1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm2aQ9DAR1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm2aQ9DAR1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm2aQ9DAR1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm2aQ9DAR1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm2aQ9DAR1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm2aQ9DAR1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm2aQ9DAR1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cmtm2aQ9DAR1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm2aQ9DAR1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm2aQ9DAR1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm2aQ9DAR1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm2aQ9DAR1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm2aQ9DAR1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm2aQ9DAR1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cmtm2aQ9DAR1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms