Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAH1

Scp2d1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scp2d1Q9DAH1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scp2d1Q9DAH1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scp2d1Q9DAH1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scp2d1Q9DAH1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Scp2d1Q9DAH1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scp2d1Q9DAH1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scp2d1Q9DAH1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scp2d1Q9DAH1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scp2d1Q9DAH1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scp2d1Q9DAH1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scp2d1Q9DAH1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scp2d1Q9DAH1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Scp2d1Q9DAH1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scp2d1Q9DAH1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scp2d1Q9DAH1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scp2d1Q9DAH1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scp2d1Q9DAH1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scp2d1Q9DAH1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scp2d1Q9DAH1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scp2d1Q9DAH1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scp2d1Q9DAH1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scp2d1Q9DAH1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scp2d1Q9DAH1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scp2d1Q9DAH1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scp2d1Q9DAH1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scp2d1Q9DAH1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scp2d1Q9DAH1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scp2d1Q9DAH1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scp2d1Q9DAH1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scp2d1Q9DAH1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scp2d1Q9DAH1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scp2d1Q9DAH1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scp2d1Q9DAH1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scp2d1Q9DAH1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scp2d1Q9DAH1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scp2d1Q9DAH1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scp2d1Q9DAH1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scp2d1Q9DAH1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scp2d1Q9DAH1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Scp2d1Q9DAH1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scp2d1Q9DAH1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Scp2d1Q9DAH1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scp2d1Q9DAH1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms