Protein–RNA interactions for Protein: Q9D968

Hcfc2, Host cell factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc2Q9D968 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hcfc2Q9D968 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hcfc2Q9D968 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms