Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8V0

Hm13, Minor histocompatibility antigen H13, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hm13Q9D8V0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hm13Q9D8V0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hm13Q9D8V0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hm13Q9D8V0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hm13Q9D8V0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hm13Q9D8V0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hm13Q9D8V0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hm13Q9D8V0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hm13Q9D8V0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hm13Q9D8V0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hm13Q9D8V0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hm13Q9D8V0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hm13Q9D8V0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hm13Q9D8V0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hm13Q9D8V0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hm13Q9D8V0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hm13Q9D8V0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Hm13Q9D8V0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hm13Q9D8V0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hm13Q9D8V0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hm13Q9D8V0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hm13Q9D8V0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hm13Q9D8V0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hm13Q9D8V0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hm13Q9D8V0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hm13Q9D8V0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hm13Q9D8V0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hm13Q9D8V0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hm13Q9D8V0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hm13Q9D8V0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hm13Q9D8V0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hm13Q9D8V0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hm13Q9D8V0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hm13Q9D8V0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hm13Q9D8V0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hm13Q9D8V0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hm13Q9D8V0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hm13Q9D8V0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hm13Q9D8V0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hm13Q9D8V0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hm13Q9D8V0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hm13Q9D8V0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hm13Q9D8V0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hm13Q9D8V0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hm13Q9D8V0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hm13Q9D8V0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hm13Q9D8V0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hm13Q9D8V0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hm13Q9D8V0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hm13Q9D8V0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hm13Q9D8V0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hm13Q9D8V0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hm13Q9D8V0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hm13Q9D8V0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hm13Q9D8V0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hm13Q9D8V0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hm13Q9D8V0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hm13Q9D8V0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hm13Q9D8V0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hm13Q9D8V0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hm13Q9D8V0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hm13Q9D8V0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hm13Q9D8V0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hm13Q9D8V0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hm13Q9D8V0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hm13Q9D8V0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hm13Q9D8V0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hm13Q9D8V0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hm13Q9D8V0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hm13Q9D8V0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hm13Q9D8V0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hm13Q9D8V0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hm13Q9D8V0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hm13Q9D8V0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hm13Q9D8V0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hm13Q9D8V0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hm13Q9D8V0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hm13Q9D8V0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hm13Q9D8V0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hm13Q9D8V0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hm13Q9D8V0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hm13Q9D8V0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hm13Q9D8V0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hm13Q9D8V0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hm13Q9D8V0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hm13Q9D8V0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hm13Q9D8V0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hm13Q9D8V0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hm13Q9D8V0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hm13Q9D8V0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hm13Q9D8V0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hm13Q9D8V0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hm13Q9D8V0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hm13Q9D8V0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hm13Q9D8V0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hm13Q9D8V0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hm13Q9D8V0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hm13Q9D8V0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hm13Q9D8V0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hm13Q9D8V0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms